Současně ale nikdy neopustil Moravský kras. I během archeologických výzkumů řídil práce na podzemní řece Punkvě za propastí Macocha. Zde sváděl náročný technický boj s hlubokými sifony – zatopenými úzkými useky jeskyně, které bylo nutné překonat pomocí čerpadel a strojní techniky. Výsledek byl ohromující: v roce 1933 se podzemní částí Punkvy projeli první návštěvníci na lodičkách.
Absolonovy výzkumy v Dolních Věstonicích skončily v roce 1938, kdy jižní Moravu obsadil Wehrmacht a přičlenil ji k Velkoněmecké říši.
Anthropos – sen, který se za života nenaplnil
Karel Absolon snil o vybudování mezinárodního vědeckého ústavu pro výzkum pleistocenního člověka. Základy této vize položil v roce 1928, kdy na brněnském výstavišti uspořádal rozsáhlou výstavu Člověk a jeho rod, později známou jako Anthropos. Výstava vzbudila mimořádný ohlas a stala se zárodkem stejnojmenné instituce.
Přestože Absolon dokázal získat podporu osobností jako byl tehdejší český prezident T. G. Masaryk nebo podnikatel Tomáš Baťa, narážel opakovaně na nedostatek finančních prostředků k výstavbě plnohodnotného výzkumného institutu.
zdroj: program.rozhlas.cz / archiv Ústavu Anthropos MZM
Naděje na rozvoj navíc zhatila druhá světová válka, kdy nacisté převzali vedení muzea, expozici ve výstavním pavilonu upravili podle své ideologie a znemožnili seriózní vědeckou práci. Absolon byl navíc v roce 1938 penzionován, byla mu znemožněna veškerá vědecká činnost a zabavena část osobní knihovny i výzkumné dokumentace. Vědci se sbírky snažili ukrýt na zámku v Mikulově, většinu z nich však v roce 1945 zničil požár. Zachránit se podařilo jen některé umělecké předměty, mezi nimiž byla například věhlasná Věstonická venuše.
Po válce už Absolon neměl možnost navázat na svůj projekt ani obnovit předchozí výzkumy či vliv. K obnovení a rozšíření Anthroposu do podoby skutečného ústavu došlo až v 60. letech díky nové generaci odborníků. Dnes je Anthropos je nejvýznamnější institucí v Česku, která popularizuje a prezentuje poznatky o počátcích lidstva, evoluci člověka, pravěkém umění a životě v době kamenné.
Poválečná kariéra
Po válce žil Absolon v Brně, kde se věnoval mladé generaci speleologů a archeologů – mimo jiné Janu Jelínkovi a Karlu Valochovi, z nichž se později stali významní čeští archeologové. Zpět získal i svou osobní knihovnu, která je dnes uložena v památníku Karla Absolona Moravského zemského muzea.
zdroj: mzm.cz / Památník Karla Absolona
Posledních patnáct let svého života věnoval Absolon dokončení rozsáhlých rukopisů o balkánské jeskynní fauně a krasových oblastech kolem řek Ombly a Timava. Současně připravoval světový atlas chvostoskoků – drobných bezobratlých živočichů, kteří ho fascinovali celý život – a rozšiřoval soubor rešerší Biospeleologica balcanica. Vracel se tak k tématům, které znal nejlépe a jimž se věnoval už na počátku své vědecké dráhy.
Každý z těchto rukopisů měl stovky stran a tisíce ilustrací. Bylo stále jasnější, že se mu tak objemná díla nepodaří v poválečných podmínkách vydat. Absolon byl navíc známý tím, že svá díla často nedokončil. Nikoliv z nedbalosti, ale protože odmítal kompromisy. Chtěl nabídnout vždy maximálně komplexní pohled a jakékoliv zjednodušení považoval za nepřijatelné.
Život vědce, který chtěl poznat zemi i člověka do hloubky
Karel Absolon zasvětil život objevování – od jeskyní Moravského krasu po paleolitická sídliště střední Evropy. Prozkoumal množství jeskyní, vytvořil podrobné mapy krasových oblastí a díky svému týmu objevil světoznámou Věstonickou venuši. Věnoval se nejen speleologii a archeologii, ale také zoologii, geologii a popularizaci vědy.
Byl energickým organizátorem, inspirativním učitelem a cílevědomým badatelem. Jeho vědecký záběr přesáhl hranice i generace. Zemřel 6. října 1960 v Brně, kde jeho památku dodnes připomíná vápencový náhrobek – stejně pevný a výrazný jako jeho celoživotní odkaz.